Gdy James chowa się do szafy przed Piramidogłowym, nie wyłącza latarki, z której światło jest doskonale widoczne przez szparę pomiędzy drzwiami mebla. Mimo to potwór nawet go nie zauważa.
Gdy James chowa się do szafy, ładuje jeden nabój do pistoletu i strzela dziesięć razy, opróżniając magazynek. Gdy przerywnik filmowy się kończy, pistolet jest naładowany. W magazynku jest tyle nabojów, ile było przed rozpoczęciem cutscenki.
Na znakach umiejscowionych w South Vale widać ograniczenia prędkości, wyrażone w kilometrach na godzinę. Akcja gry toczy się w USA, gdzie jako jednostki szybkości używa się mili na godzinę.
Za każdym razem, gdy James wchodzi po schodach lub z nich schodzi, jego nogi ruszają się w taki sam sposób, jak gdyby poruszał się po płaskiej powierzchni.
Gdy Maria zwisa do góry nogami, jej włosy są ułożone nienaturalnie zamiast swobodnie opadać w dół.
Nie wiadomo, gdzie dokładnie znajduje się Silent Hill, ale tablice rejestracyjne wszystkich samochodów w grze pochodzą ze stanu Michigan (USA).
Gdy James trzyma w rękach piłę łańcuchową i przez kilka sekund stoi nad ciałem zabitego mutanta, podnosi broń do góry i wydaje z siebie okrzyk bojowy. Jest to nawiązanie do postaci Asha z serii filmów "Martwe zło".
Blue Creek Apartment, jeden z budynków, do którego trafia James, stanowi nawiązanie do filmu "Blue Velvet". Powtarza się słowo "Blue", "Creek" to synonim do słowa "River" (ang. rzeka), które znalazło się w filmowym hotelu "Deep River". Poza tym, pokoje hotelowe w grze i filmie wyglądają bardzo podobnie.
Nazwy ulic w Silent Hill pochodzą od nazwisk pisarzy: Lewisa Carrolla, Lindsey Davis, Thomasa Harrisa, Ruth Rendell, Johna Sanforda, Davida Wiltse i Andrew Vachssa.
Ciało człowieka siedzącego przed telewizorem w pokoju 208 w Wood Side Apartments ma ten sam model postaci, co James Sunderland. Identyczne są ubranie, sylwetka i twarz. Przez nieruchomą kamerę nie da się tego jednak zobaczyć bez zainstalowania stosownej modyfikacji.
Potwór typu Straightjacket jest inspirowany podwładnym dyrektora artystycznego, który przychodził do pracy w bluzie z kapturem, kołysząc się na boki podczas słuchania muzyki z przenośnego odtwarzacza.
List od Mary do Jamesa, w którym kobieta prosi męża, by przyjechał do Silent Hill i spotkał się z nią, w pewnym momencie gry zmienia się w pustą kartkę papieru.